基于众包的天然产物数据库及知识发现系统 - 18新利直播

CN 41-1437/TS ISSN 2096-1553

基于众包的天然产物数据库及知识发现系统

郑乃仁,邓玉林,Venkat MATHURA,Fiona CRAWFORD

郑乃仁, 邓玉林, Venkat MATHURA, 等. 基于众包的天然产物数据库及知识发现系统[J]. 轻工学报, 2016, 31(4): 102-108. doi: 10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

引用本文:郑乃仁, 邓玉林, Venkat MATHURA, 等. 基于众包的天然产物数据库及知识发现系统[J]. 轻工学报, 2016, 31(4): 102-108.doi:10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

ZHENG Nai-ren, DENG Yu-lin, MATHURA Venkat and et al. Crowdsourcing-based natural products database and knowledge discovery system[J]. Journal of Light Industry, 2016, 31(4): 102-108. doi: 10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

Citation:ZHENG Nai-ren, DENG Yu-lin, MATHURA Venkat and et al. Crowdsourcing-based natural products database and knowledge discovery system[J]. Journal of Light Industry, 2016, 31(4): 102-108.doi:10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

基于众包的天然产物数据库及知识发现系统

北京理工大学生命学院, 北京 100081;
Roskamp研究所, 佛罗里达 34243
基金项目:国家重大科学仪器设备开发专项课题（2012YQ04014005）
中图分类号:R857.3

Crowdsourcing-based natural products database and knowledge discovery system

School of Life Science, Beijing Institute of Technology, Beijing 100081, China;
Roskamp Institute, FL 34243, United States
Received Date:2016-05-03
Available Online:2016-07-15
CLC number:R857.3

摘要:针对目前天然产物数据库数据更新不及时、数据量不够大等问题，开发了基于众包的天然产物数据库及知识发现系统.该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库，使用分子指纹对分子结构进行编码，并采用Tanimoto系数计算相似度实现天然产物和相关文献的检索，可以实时扩充，并为生物学家了解当前研究热点，确定进一步研究方向提供参考.
- 众包/
- 天然产物数据库/
- 知识发现系统
Abstract:In view that the present natural products database data update was not in time, the data quantity was not big enough, the natural products database and knowledge discovery system was developed based on crowdsourcing.The system used the crowdsourcing technology to build a natural products database, used molecular fingerprint to encode molecular structure, and used the Tanimoto coefficient to calculate similarity to realize natural products and related literature retrieval,and could expand real-time for biologists to understand the current research hotspot and to offer reference to determine further research directions.
- crowdsourcing/
- natural product database/
- knowledge discovery system
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通讯作者:陈斌, bchen63@163.com

1.
沈阳化工大学材料科学与工程学院沈阳 110142

郑乃仁, 邓玉林, Venkat MATHURA, 等. 基于众包的天然产物数据库及知识发现系统[J]. 轻工学报, 2016, 31(4): 102-108. doi: 10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

引用本文:郑乃仁, 邓玉林, Venkat MATHURA, 等. 基于众包的天然产物数据库及知识发现系统[J]. 轻工学报, 2016, 31(4): 102-108.doi:10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

ZHENG Nai-ren, DENG Yu-lin, MATHURA Venkat and et al. Crowdsourcing-based natural products database and knowledge discovery system[J]. Journal of Light Industry, 2016, 31(4): 102-108. doi: 10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

Citation:ZHENG Nai-ren, DENG Yu-lin, MATHURA Venkat and et al. Crowdsourcing-based natural products database and knowledge discovery system[J]. Journal of Light Industry, 2016, 31(4): 102-108.doi:10.3969/j.issn.2096-1553.2016.4.015

基于众包的天然产物数据库及知识发现系统

北京理工大学生命学院, 北京 100081;
Roskamp研究所, 佛罗里达 34243

收稿日期: 2016-05-03
网络出版日期: 2016-07-15

基金项目:国家重大科学仪器设备开发专项课题（2012YQ04014005）

关键词:

摘要:针对目前天然产物数据库数据更新不及时、数据量不够大等问题，开发了基于众包的天然产物数据库及知识发现系统.该系统利用众包技术构建一个天然产物数据库，使用分子指纹对分子结构进行编码，并采用Tanimoto系数计算相似度实现天然产物和相关文献的检索，可以实时扩充，并为生物学家了解当前研究热点，确定进一步研究方向提供参考.

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